摩尔庄园的战斗玩法融合了属性克制、职业分工与精灵养成三大特色，让战斗既充满策略性又不失休闲乐趣。在野外遇到怪物时，屏幕右侧会出现标靶按钮，点击后进入战斗场景。备战环节能看到敌我阵容及属性克制关系，火、水、地、风四种属性形成循环克制链，比如水克火、火克风、风克地、地克水。如果战斗力碾压对手，还能直接跳过战斗快速结算，这种设计兼顾了效率与深度。
战斗中最有趣的环节是精灵捕捉系统。使用不同等级的胶片捕捉野生精灵时，成功率和精灵血量、胶片品质挂钩。特级胶片基本不会失手，而普通胶片建议在怪物残血时使用。捕捉到的精灵能成为你的战斗伙伴，它们拥有专属成长属性和天赋技能，通过加点培养可以强化战力。最多能携带5只精灵参战，3只主力和2只替补都能获得经验，这种全员成长的机制让养成过程更轻松。
完成前置任务后可以选择剑士、法师或牧师职业，每种职业都有独特的技能和装备路线。剑士擅长近战物理输出，法师掌控范围魔法攻击，牧师则专注于治疗辅助。战斗中能设置自动释放技能，也能手动操作调整策略。职业与精灵的组合搭配，让每场战斗都有丰富的战术选择空间。
自动战斗功能适合休闲玩家，而手动操作能体验属性克制和技能连招的乐趣。精灵阵容可以随时调整，针对不同敌人切换属性克制的出战队伍。战斗结束后所有参战精灵共享经验，避免了重复刷图的枯燥感。摩尔庄园的战斗既保留了传统RPG的策略深度，又通过简化操作和共享机制降低了上手门槛。
