选择合适的精灵对游戏进程至关重要。初始阶段可从妙蛙种子、小火龙和杰尼龟三只精灵中选择一只，它们各有特点：妙蛙种子是草/毒双属性，技能均衡且能提供团队支持；小火龙作为火属性后期进化成喷火龙后输出强劲；杰尼龟防御突出，水系技能能有效应对早期岩石系道馆。这三只精灵的最终进化形态都能成为队伍核心，选择需结合个人战术偏好。
游戏中期推荐重点捕捉皮卡丘、卡比兽等潜力精灵。皮卡丘在常磐森林有较低概率出现，虽然前期战力有限，但电属性对水系和飞行系有显著克制效果；卡比兽则拥有极高的物攻和HP，即使速度偏低也能通过高耐久反制对手。月见山深处可获得的化石精灵（化石盔或菊石兽）经过复活后能提供独特的岩石/水属性组合，弥补队伍短板。野外训练时注意保持精灵球储备，遇到稀有精灵时可先用技能削弱其血量再尝试捕捉。
后期团队构建需考虑属性平衡与神兽捕捉。三圣鸟（急冻鸟、闪电鸟、火焰鸟）分别位于双子岛、无人发电厂和灯火山顶，捕捉前需解谜或穿越复杂地形。急冻鸟需用岩石堵住瀑布水流，闪电鸟在发电厂迷宫最深处，火焰鸟则需携带水系精灵应对其火属性技能。神兽不仅战力出众，其特殊属性也能填补队伍弱点。同时建议培养一只飞行系精灵如比雕，其高速与飞行属性在通关过程中实用性极高。
超梦作为剧情终极精灵虽难以捕捉，但超能力属性配合高种族值堪称最强战力；胡地通过游戏厅代币兑换获得，特攻与速度极为出色；暴鲤龙由弱小的鲤鱼王进化而来，水系加飞行属性带来独特打击面。注意通过技能机为精灵配置互补招式，例如为水系精灵学习冰系技能以应对龙属性敌人。精灵强度并非唯一标准，属性克制链的完整度往往比个体数值更重要。
游戏过程中随时调整队伍是持续进步的关键。不同道馆战前可临时更换针对性精灵，例如用草系应对水系馆主。野生原野区的稀有精灵如袋龙具备独特战术价值，而通信进化精灵如耿鬼则需要联机交换才能发挥全部潜力。记住没有绝对完美的阵容，根据当前关卡特性灵活调整才是通关精髓。
